Fundada em 1682 pelos jesuítas, a cidade de São Borja é a primeira redução dos chamados Sete Povos das Missões. É a cidade mais antiga do Estado do Rio Grande do Sul. Emancipou-se do município de Rio Pardo em 1887.
Banhada pelo Rio Uruguai, faz fronteira com a cidade de Santo Tomé, na Argentina. A transição entre as duas cidades se dá através da Ponte Internacional da Integração, inaugurada no ano de 1998.
A cidade é conhecida como Terra dos Presidentes. Pois na cidade nasceram dois dos mais importantes Presidentes da República: Getúlio Vagas e João Goulart. Também já foi considerada a capital do linho, devido a grande produção.
Atualmente, a cidade possui cerca de 63mil habitantes. É bem destacada no campo da educação, pois conta com uma universidade federal – Universidade Federal do Pampa (UNIPAMPA); Um instituto federal de educação técnica e superior – IFFarroupilha; Uma universidade estadual –Uergs; duas faculdades de Educação à Distância – Anhanguera e Uninter. Além de escolas municipais, estaduais e privadas.
Possui bastante destaque também no quesito Pontos Turísticos, sendo uma das mais ricas do Estado. Os principais e mais visitados são o Cais do Porto Internacional, onde também ocorrem grandes eventos; a Ponte da Integração, o Parque General Vargas e o Cemitério Jardim da paz.